学院荣誉拥有药学和中药学一级学科硕士点、中药学专业学位硕士点、二级学科博士点。2003年成立温州医学院基础课（分析测试）实验教学示范中心，并在2007年被评为浙江省实验教学示范中心，2010年药学实验教学中心被评为浙江省实验教学示范中心。2005年建立国家新药开发工程技术研究中心制剂工程研究基地。2006年分别建立基因工程药物国家工程研究中心中试研究基地、教育部生物反应器与药物开发工程研究中心中试实验室、浙江省浙南特色中药重点实验室；承担中国医药质量管理协会GAP工作委员会的工作；2007年成立浙江省生物技术制药工程重点实验室。2008年药理学与生化药学被列为浙江省“重中之重”学科，中药学学科被评为温州市重点学科。三年来，荣获国家技术发明二等奖1项、国家科技进步二等奖1项、中华医学科技一等奖1项、中国药学会科技一等奖1项、吴阶平医学研究奖-保罗杨森药学研究奖二等奖1项。学院始终立足“以教学为本”,取得丰硕成果：2010年药学专业被评为国家特色专业；1门课程被评为国家精品课程，4门课程被列为浙江省精品课程；浙江省教学成果一等奖1项、浙江省教学团队1个；浙江省教学名师2名、浙江省教坛新秀2名；浙江省教学示范中心2个；浙江省高校重点建设教材3部。指导学生先后获得大学生“挑战杯”比赛国家二等奖、浙江省特等奖、一等奖等各项荣誉。学院规模温州医科大学药学院设立药学系、中药学系、制药工程系、分析测试中心、药学实验中心和执业药师培训与继续教育中心。现招收药学专业、中药学专业、制药工程专业本科生，药理学和中药学两个专业硕士生和药学专升本、药学自考生。学院现有教师86人，其中高级职称31位；博士22位，硕士47位；博士生导师3人，硕士生导师30人。拥有“长江学者”特聘教授1人、教育部新世纪优秀人才1人、“新世纪百千万人才工程”国家级人选1人、国家“千人计划”入选1人、“钱江学者”1人、浙江省特聘教授1人、浙江省海外特聘专家1人、国家教学指导委员会药学专业分委员会委员1人、浙江省教学指导委员会委员2人、浙江省“千人计划”2人、浙江省“151”、温州市“551”各层次人选、省优秀博士后、中青年学科带头人、浙江省卫生高层次创新人才等20人。近几年我们大力引进高素质师资，重视青年教师培养，常年聘请国内外药学知名专家组成专家咨询委员会，精心培养在职教学和科研骨干教师，已初步形成一支结构合理、水平较高的人才队伍。学院拥有核磁共振（600MHz）、液-质联用、气-质联用、高压液相色谱仪、气相色谱仪、中压制备色谱仪、紫外可见分光光度计、HPLC电化学检测器等20多种大型的科研教学设备和各种科研教学仪器，总值1500多万。学院项目学院目前已与美国路易斯威尔大学、美国哈佛大学、加拿大萨斯卡切温大学、美国杜克大学医学中心、英国诺华医药集团、中科院成都生物所和有机所、同济医科大学等建立了教学、科研合作关系。近年来，承担了包括国家新药创制重大科技专项、863计划项目、973计划项目、国家自然科学基金项目、国家“十一五”科技支撑计划、浙江省自然科学基金杰青团队项目等国家、省部级各类课题达72项；获得国家技术发明二等奖、国家科技进步二等奖、中华医学科技一等奖等，在国内外专业刊物发表论文约350篇，其中，被SCI收录100余篇；授权发明专利10余项，出版教材、专著20余部；学院在天然药物研究、创伤修复、临床药理、神经药理研究、农药解毒研究方面形成了稳定的研究方向。实习基地学院实习基地建设日趋完善，目前已在江苏恒瑞医药股份有限公司、扬子江药业集团公司、浙江医药股份有限公司新昌制药厂等国内知名企业及温州市药品检验所等40余个机构成立了实习基地，在天然药物资源丰富的泰顺乌岩岭国家自然保护区、温州龙湾潭国家森林公园等6个区域成立了野外见习基地。
随着国家医药分开，临床药物行业执业药师准入制等有关政策、法规的实施，为药学院提供了广阔的发展空间，药学及其相关人才的紧缺为毕业生提供了良好的就业前景。学院地址通讯地址：浙江温州茶山高教园区温州医学院药学院